医学院包括临床医学、基础医学、公共卫生与预防医学等博士点。工学院则有机械工程、材料科学与工程、控制科学与工程、计算机科学与技术、环境科学与工程等博士点。商学院提供管理科学与工程、工商管理等博士点。人文学院设有中国语言文学、历史学、哲学、法学等博士点。
南昌大学工学类博士专业包括机械工程、能源动力工程、电气工程、控制科学与工程等，这些专业覆盖了工程技术领域的多个方向，旨在培养具有科技创新精神和实践能力的高层次专门人才。
截至2021年4月，南昌大学江西医学院拥有三个一级学科博士点，分别是临床医学、基础医学和药学。这意味着，对于希望进一步深入研究医学领域的人士而言，这些博士点提供了丰富的学术资源和研究机会。
45个学术类硕士学位授权一级学科，1种博士专业学位授权（临床医学）和18种硕士专业学位授权，11个博士后科研流动站。学校化学、临床医学、农业科学（食品科学与工程为主）、工程学4个学科进入美国ESI排名前1%。在全国第三轮一级学科整体水平评估中，食品科学与工程学科位列全国同类学科第4名。
南昌大学研究生院专业：公共管理、 工商管理、工程等16个工程领域、法律、 临床医学、口腔医学、教育、艺术、翻译、旅游、新闻传播、 农业推广，高校教师在职攻读硕士等15个专业。
南昌大学理学院是一个集数学、物理、化学和管理科学与工程为一体的综合性学院，包含数学系、物理系、化学系和管理科学与工程系等四个系。
南昌大学土木工程专业没有博士点。因为南昌大学结构工程的研究生只有力学这方面的有博士点，其他的建工其他专业没有博士点。南昌大学的优势学科发展，前些年全国排名60-70，现在根据教育部2011年最新公布的土木工程专业等级排名，很有权威性的，全国20来位，超过武汉理工大学，等级未A及A+的都很不错。
机械工程 机械工程专业是南昌大学的老牌专业，1958年成立的，这个专业也是各大高校广泛开设的专业之一。机械工程专业现放在机电工程学院，该专业拥有博士点和博士后流动站，在全国的同等专业排名27。实力还是不错的。
生理学、细胞生物学、免疫学等。根据查询南昌大学抚州医学院学校官网，截止2023年7月21日，南昌大学抚州医学院博士点一级学科点有15个，包括生理学、细胞生物学、免疫学等专业。南昌大学抚州医学院，即南昌大学抚州校区，坐落在著称的历史文化名城—抚州市，设有本科和专科两个层次的医学教育。
在学术人才的培养上，南昌大学近40人次获得了国家级、省部级的荣誉和奖项。此外，南昌大学的教学质量在行业内也颇具声誉，拥有1个国家级教学团队和2个江西省高水平本科教学团队。然而，南昌大学在博士点设置上，目前并未涵盖计算机学科。
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