南开大学有机化学考研是考数学二还是综化取决于自己的成绩，数学好就选择数学，化学好就选择化学，考研报名时自己选择其中一科即可。
专业课除应用化学专业外，需要考综合化学和专业化学。
经查询高校化学考研科目规定，化学考研是不需要考试数学学科的，即化学研究生考试没有数学科目。化学考研考试4门科目，分别是思想政治、外语、业务课业务课二，满分500分。注意，业务课业务课二为高校自主确定考试科目或自主命题。
思想政治理论。英语。综合化学，包括有机化学，无机化学，分析化学和物理化学中的一门，具体考试科目视报考院校而定。化学实验理论和操作。
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